Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cfap58B2RW38 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms