Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh2B2RVB7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hbb-bh2B2RVB7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms