Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc8B2RUS7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc8B2RUS7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc8B2RUS7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms