Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a28B2RT89 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms