Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc2B2RR83 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc2B2RR83 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms