Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms