Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm2012B1B0R1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2012B1B0R1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms