Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm436B1AVU6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm436B1AVU6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms