Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scml2B1AVB3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scml2B1AVB3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms