Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhox1B1APN4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms