Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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