Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp4A4UUI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp4A4UUI3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms