Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc9bA3KGF9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms