Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms