Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a4A2AX52 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a4A2AX52 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col6a4A2AX52 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms