Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rtf1A2AQ19 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms