Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AI481877A2ALV5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AI481877A2ALV5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms