Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ambra1A2AH22 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms