Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap5A2AGT5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ckap5A2AGT5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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