Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930447F04RikA2AFR2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms