Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2dnl1A2AFH1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms