Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap29-1A2A5X4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms