Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm6268A2A3U9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm6268A2A3U9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm6268A2A3U9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm6268A2A3U9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm6268A2A3U9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm6268A2A3U9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm6268A2A3U9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm6268A2A3U9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms