Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4921501E09RikA0A0R4J054 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms