Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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