Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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