Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Rabgef1Q9JM13 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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