Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

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Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Rb1cc1Q9ESK9 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rb1cc1Q9ESK9 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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