Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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