Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cldn22Q9D7U6 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cldn22Q9D7U6 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Cldn22Q9D7U6 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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