Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccdc18Q640L5 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccdc18Q640L5 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccdc18Q640L5 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccdc18Q640L5 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ccdc18Q640L5 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ccdc18Q640L5 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ccdc18Q640L5 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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