Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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