Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ttc39dQ0VF76 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
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Ttc39dQ0VF76 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ttc39dQ0VF76 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ttc39dQ0VF76 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ttc39dQ0VF76 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ttc39dQ0VF76 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ttc39dQ0VF76 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms