Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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