Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Sh3bp1P55194 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Sh3bp1P55194 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Sh3bp1P55194 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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