Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms