Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RxraP28700 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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