Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prim1P20664 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms