Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccl20O89093 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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Ccl20O89093 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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