Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Atxn3Q9CVD2 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atxn3Q9CVD2 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Atxn3Q9CVD2 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Atxn3Q9CVD2 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atxn3Q9CVD2 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atxn3Q9CVD2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atxn3Q9CVD2 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atxn3Q9CVD2 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Atxn3Q9CVD2 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Atxn3Q9CVD2 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atxn3Q9CVD2 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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