Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccdc18Q640L5 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccdc18Q640L5 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms