Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Shank3Q4ACU6 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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