Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd10P28359 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms