Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Hoxd9P28357 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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