Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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