Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PtprsB0V2N1 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PtprsB0V2N1 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PtprsB0V2N1 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PtprsB0V2N1 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PtprsB0V2N1 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PtprsB0V2N1 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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PtprsB0V2N1 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PtprsB0V2N1 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PtprsB0V2N1 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PtprsB0V2N1 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PtprsB0V2N1 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PtprsB0V2N1 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PtprsB0V2N1 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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