Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms