Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hdac5Q9Z2V6 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hdac5Q9Z2V6 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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