Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms