Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms